智能卡的一個主要功能就是進行電子支付，包括基于Internet平臺為電子商務服務的網絡支付。在Internet上，智能卡基本具備兩種網絡支付模式，即智能卡的在線支付模式和離線支付模式，而且這兩種支付方式均是相當安全的，都用到私有/公開密鑰加密技術、數字簽名、數字摘要以及數字證書技術等。

由于智能卡的存儲能力強大，其卡中可以存入電子現金這樣的網絡貨幣，因而持卡人就可使用智能卡進行離線支付。

所謂離線支付，不是說智能卡與持卡客戶或商家的計算機離線，而是指使用智能卡進行網絡支付時，智能卡的讀卡器不需要和發卡銀行的網絡實時連接，即無需銀行的實時中介支付處理，而直接通過讀卡器的讀／寫功能完成支付結算。

智能卡的離線支付使得持卡人的網絡支付行為，不再受到網絡好壞與銀行處理效率的影響，使支付更加方便快捷，擴大了智能卡的使用范圍。

不過離線支付必須使用讀／寫卡設備，而且基本上只適用于在卡內存放電子現金、電子零錢等網絡貨幣的智能卡，因為只有這些網絡貨幣的轉讓不需要銀行的實時中介。

1、智能卡持卡客戶到發行電子現金的銀行申請電子現金，將電子現金下載存入智能卡。

2、持卡客戶在網上商家網站選訂購買的商品，填寫訂單，選擇智能卡支付。

3、支付時將智能卡插入智能卡讀卡器中。

4、客戶輸入智能卡PIN，確認支付金額。

5、讀卡器對客戶輸入的PIN與卡中的PIN自動比較，如果一致，打開智能卡，受理支付請求。

6、讀卡器將客戶智能卡中的電子現金發送商家(或許商家也應用智能卡存放電子現金)。這個過程中讀卡器需要進行查對黑名單、核實資金是否夠用、對支付后的余額進行更新等處理，且將交易記錄登記到自身的日志文件和客戶的智能卡中。